首页中国农业科学院棉花研究所（简称中棉所）于 1957 年 8月在北京成立，1958 年 3 月迁至河南安阳。
作为唯一的国家级棉花专业综合科研机构，中棉所以应用研究和应用基础研究为主，组织和主持全国性的重大棉花科研项目，着重解决棉花生产中的重大科技问题，开展国际棉花科技合作与交流，培养棉花科技人才，宣传推广科研成果与先进的植棉技术，编辑出版有《棉花学报》《中国棉花》和 Journal of Cotton Research 专业期刊。
现有在职职工 428 人，其中科技人员 285 人，研究员 55人，副研究员 75 人；中国工程院院士 1 人，国际欧亚科学院院士 1 人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者 1 人，国家高层次人才特殊支持计划入选者 4 人，全国创新争先奖状获得者 2 人，中原学者 3 人，中华农业英才奖获得者 2 人，全国农业科研杰出人才 4 人；博士生导师 26 人，硕士生导师 70 人；博士后流动站在站人员 13 人；在所研究生 385 人，其中留学生 25 人。2013 年入选中国农业科学院科技创新工程第一批试点研究所，组建了 12 支创新团队。2016 年牵头棉花全产业链 200 余家单位组建成立国家棉花产业联盟。
中棉所拥有棉花生物学国家重点实验室和棉花生物育种及产业技术国家工程研究中心等 12 个国家级科研平台，农业农村部植物生态环境安全监督检验测试中心（安阳）及农业农村部棉花品质监督检验测试中心等 9 个省部级科研平台。
建所至今，几代中棉所人秉承“艰苦奋斗、甘于奉献、勤于实践、勇于创新”的“中棉所精神”，开拓进取，砥砺奋进，育成棉花品种 153 个，小麦品种 29 个，玉米品种 2个，中棉所棉花品种一度占全国种植面积的 50%。获省部级以上成果奖励 92 项，其中国家级奖 23 项，包括一等奖 4 项。中棉所先后完成了二倍体雷蒙德氏棉（D 基因组）、二倍体亚洲棉（A 基因组）以及棉花四倍体（A/D 组）全基因组测序及图谱绘制工作，在国际棉花基因组测序领域占据领先地位。
1988 年至今被中共河南省委、河南省人民政府命名为文明单位，并先后多次获得中国农业科学院院级文明单位和文明单位标兵荣誉称号。